蛋白質結晶学四方山話
おうちでできる構造解析
構造生物学に関する備忘録
Home
> 蛋白質結晶学四方山話
鈴木先生が公開されていました資料をまとめております。(移行中)
勉強部屋
武部さんのベイズの定理(pdf)
東さんのフーリエ変換(pdf)
武部さんの最小二乗法
東さんの結晶構造解析とフーリエ変換(pdf)
武部さんの実践結晶構造解析(pdf)
折り紙
折り紙で学ぶウイルスの構造
:ウイルスの形を折り紙で学びます。(全4回)
結晶学小ネタ
Fourie transform(ShaFFTを利用しました)(pdf)
Cootのインストールだけでできる分子モデリングの練習(pdf)
リアルタイム2次元FFTプログラム
(大久保先生作)
道具箱の項目にソフトのリンクがあります。
結晶学を学ぶツール
XRayView
逆格子、回折球、回折点、検出器距離などが分かりやすいです。
結晶学の講義資料
ケンブリッジのProtein Crystallography Course
リンク集
International Table いらず?
日本の蛋白質結晶学者の交流の場(Biokids)
タンパク質結晶構造解析関係マニュアル@東大の伏信さんのページ
PyMOL
インストール
基本操作
コマンドの基本
作図に役立つコマンド+α
静電ポテンシャルの表示
疎水性度の表示
保存度による色分け
3DCGプリント
ラベル
分子の重ね合わせ
水素結合
距離の測り方
カメラ方位
リガンド結合部位の表示
電子密度マップ mesh
電子密度マップ volume
電子密度マップ FFT
ボール&スティックモデル
cavityの表示
pocketの表示
相互作用部位の表示
動画の作り方 GUI編
動画の作り方 コマンド編
二次構造の割り当て(DSSP)
透明
温度因子
点変異の導入
おうちでできる構造解析
概要
インストール & 準備
iMosflm
SCALA
Matthews係数
分子置換モデル
位相決定(分子置換法)
分子モデル構築
HKL2000 概要
HKL2000
HKL2000 scalepack2mtz
空間群の決定
HKL2000 ログを読む
3Dプリンター
構造生物学と
3Dプリンター
ソフトウェア
ダウンロード
surfaceモデル
ワームモデル
リボンモデル
サイズの変更 netfabb
その他
蛋白質結晶学四方山話
保存度による色分け
(chimera編)
Excelでまとめる
アライメント
PowerPoint
オリジナルテンプレート
アニメーションGIFの
作り方 giam編
アニメーションGIFの
作り方 ImageMagick編
初めてのPDB登録
CCP4mg動画